液体活检迈向3.0时代，基因大数据将如何在临床等多领域发挥价值？

7月中旬，热闹的苏州工业园区再次迎来盛会——第七届基因大数据年会（BDCG-7）。该会议由国家生物药技术创新中心指导、吉因加基因研究院联合苏州生物医药产业园举办，汇集肿瘤、感染、病理、检验、新药研发、复杂疾病及健康关岭等多领域300多名专家和代表，为多组学时代的精准医疗发展贡献智慧和力量。

大会的主题开宗明义——“探索组学应用新‘液’态”，将多组学、大数据、液体活检、NGS应用等最能代表精准医学发展的关键词都囊括进去，也为很多新技术、新应用、新价值的探索搭建了一个切磋和碰撞的平台。

近年来，以液体活检为代表的NGS技术也成为基因研究领域中备受瞩目的创新前沿，而随着组学技术的不断突破，液体活检的应用范围也不断拓展，在肿瘤学、感染病学、复杂疾病等多领域中也表现出巨大的潜力。正如吉因加CEO易鑫博士在会上所言：“液体活检1.0是应用在肿瘤领域，标志性应用是ctDNA检测和MRD检测；2.0应用在病原领域，mNGS、tNGS等，而目前的3.0则是突破复杂疾病领域。”

技术迭代更新，液体活检3.0给业内所带来的想象空间到底有多大？以真实世界数据为基础的基因大数据又如何反哺临床及科研？新技术如何助力精准诊疗、以实现“人人医学”的梦想？本次年会，以基因大数据为基础，聚焦于液体活检在肿瘤、感染、复杂疾病及健康等领域的最新研究进展和应用案例，试图将这些碎片化的知识和图谱进行串联，助力我们走向系统化、个性化和精准化的新时代。

液体活检作为一种新兴的非侵入性检测手段，其无创、安全性高、可重复等特点，以及在一定程度上全面反映肿瘤整体变异状态、提供及时全面的疾病发展评估并实时监测等效果，使得液体活检应用范围及适用人群更广。2015年，液体活检被MIT Technology Review评为“年度十大突破性技术之一”，之后热度不减，2017年，液体活检入选世界经济论坛“2017年度全球十大新兴技术榜单”。 

年会围绕的第一大主题为“液体活检技术新应用”，中南大学湘雅医学院陈翔教授、广东省人民医院周清教授、中国医学科学院肿瘤医院马飞教授及四川大学华西医院康梅教授分享了液体活检技术在皮肤疾病、肺癌、乳腺癌及血流感染的研究新进展。

陈翔教授从临床问题切入，强调皮肤疾病的解决需要借助基于大数据多学科的交叉融合，要从对疾病机制的基础研究延伸至临床转化；周清教授详细阐述了肺癌MRD检测技术的进步和发展，强调MRD检测技术及策略选择的重要性；马飞教授则就乳腺癌MRD全病程检测提出，基于MRD检测技术来指导临床的时机已经成熟，基于检测结果指导不同分型的高危乳腺癌的治疗方案取得突破，进一步提升了乳腺癌患者的生存率。就肿瘤领域而言，液体活检已经从晚期肿瘤的耐药检测，进入到可手术肿瘤的MRD检测，并且呈现出了超越传统TNM分期的预后提示作用。

基因大数据年会的分会场之一“再定义tNGS-病原诊断”围绕感染场景的技术应用展开。中山大学附属第一医院陈传希教授、上海交通大学医学院附属第九人民医院许洁教授、中日友好医院鲁炳怀教授及吉因加杨振宇博士等专家代表围绕ICU血流感染的诊疗诉求、免疫低下患者感染诊疗难题、兼顾广度、深度和精度的病原检测技术tNGS及院内落地等问题进行了深度讨论。

在临床诊疗中，血流感染的诊断目前仍面临着巨大挑战。传统诊断方式需要血培养进行检测，这也是最简单、准确且常用的检测方法，是确认机体血流感染的病原学基础，但是阳性率很低，检测周期较长，会给临床的下一步治疗带来影响。本次会议中，四川大学华西医院康梅教授指出，目前无需基于培养的PCR、mNGS、tNGS等分子技术可在24h内完成报告，大大提升检测结果的时效性，而基于杂交捕获的tNGS技术更有望成为性能更佳且适合感染监测的检测技术。

液体活检的3.0时代迈向了复杂疾病诊断。复杂疾病包括代谢系统疾病、神经退行性疾病、自身免疫性疾病等，其诊断和治疗都面临着巨大的挑战。诚如吉因加首席医学官陈蓉蓉博士提到，目前液体活检在复杂疾病中的应用仍然处于探索阶段，还需要集合来自科研院所、医院及创新公司多方共同努力。

基因大数据年会分会场之一“复杂疾病研究”对该问题进行了探讨，上海交通大学医学院附属瑞金医院曹亚南研究员、中南大学湘雅医院李津臣教授、首都医科大学宣武医院柴国梁教授、中国科学院生物物理所胡杰教授、深圳大学苟德明教授及吉因加白晶博士围绕中国代谢解析计划ChinaMAP、基因变异解读相关工具及其在孤独症和帕金森病中的应用、神经免疫疾病的研究及多组学技术对表观遗传突变的检测、多组学技术对表观遗传突变的检测、高灵敏血浆cfRNA建库测序技术在肺动脉高压临床诊断与分型中的应用等话题进行深入讨论。

从肿瘤、到感染甚至迈向复杂疾病，液体活检技术的应用范围不断扩大，这不仅得益于组学技术不断取得突破，更有赖于基因大数据技术给予的支持。基因大数据能够帮助科研人员纵向扩大应用范围，例如从血液瘤迈向实体瘤，同时开拓新的应用范围，如目前正在探索的复杂疾病研究，为复杂疾病的认识、诊断和治疗提供更有力的科研探索工具。

基因大数据年会的第二大主题为“NGS检测在院内的落地运用”，复旦大学生命科学学院石乐明教授、复旦大学附属中山医院纪元教授、浙江省肿瘤医院苏丹教授等分享了各地落地运用及基因大数据赋能的相关研究。

石乐明教授介绍了HRD标准化项目的最新进展，该项目由国家癌症中心、中检院及复旦大学等共同发起，吉因加深度参与，旨在解决HRD检测方法、SNP位点选择及HRD score阈值缺乏标准等问题。目前，该项目已经取得阶段性成果，将在临床样本中进一步探索。

纪元教授则是从LDT新政角度对基因检测项目进行分享，复旦中山医院作为LDT试点单位，通过院长及相关部门牵头的工作小组，对LDT落地院内进行多方面考量，以确保LDT试剂检测质量和临床服务水平。她指出，除了政策、技术、应用等方面，需要医疗机构与创新生物技术企业形成合力，加快LDT产品的研发、生产和使用，满足临床急需。

苏丹教授则以浙江省肿瘤医院病理科在LDT应用方面的实践经验为例，指出LDT形式是满足MRD检测的一个可行路径，而医院要在实验室体系建设和LDT相关人员培养方面做好基础工作，同时展开了相关产品吉因加1021+MRD在院内LDT项目开展的性能确认工作。她强调，要在实践中更好地发挥检测方法的优势及理解检测方法的局限，致力于更好、更规范的MRD检测。

如何将新技术尽快落地院内？除了技术足够可靠及有效外，还需要顺应政策、设立规范。LDT新政为新技术快速院内落地打开新通道，随之而来的是规范问题，这之中包括检测可及性、实际操作、专业人员培训及数据分析判读等问题。

新技术的院内落地，不仅能够使其更快施惠于民，更能够赋能精准医学研究。据吉因加首席医学官陈蓉蓉博士介绍，过去一年多时间内，吉因加携手各大医院及专家基于基因大数据在肿瘤、病原感染及复杂疾病上产出了多项成果。她提到，“伴随着吉因加1021+MRD的院内落地及多个系列研究的开展，MRD辅助临床医生为肿瘤患者制定了更精准的治疗方案，活检技术在感染性疾病中也实现了产品转化，同时tNGS从病原鉴别分型到耐药分析，在广度、深度、精度上都实现了超越，将更快、更好地服务临床。”

液体活检3.0时代轰轰烈烈朝着更广、更深处前进，需要科研院所、医院以及生物技术创新企业等各类主体通力合作，在这其中，生物技术创新企业扮演着更为重要的角色。

2017年，吉因加成立基因研究院，并且基于液体活检、免疫组学、单细胞、甲基化等技术平台，建立了较为全面的肿瘤应用研究和产品开发体系，覆盖肿瘤临床、健康早筛、病原感染、器官移植与损伤及新药研发等领域，目前正向复杂疾病研究延伸。

迄今，吉因加已与国内外多家医疗机构、科研院所开展科研合作和临床应用研究，合作项目超700项，主持或合作13项重大专项课题，在Nature、Nature Medicine、Nature Communications、Journal of Thoracic Oncology等国际权威学术期刊累计发表SCI论文320多篇，累计影响因子超过3000分，获批专利超70项，发表软著达80余篇。

作为最早一批开展MRD临床应用的生物技术创新公司，吉因加同样走在在肿瘤、感染及复杂疾病的前列。

在肿瘤方面，吉因加全新升级1021+个性化定制MRD检测，检测区域扩大~50%增至2.3M，深度提升100%，实现＞57万样本验证，针对肺、肠、乳腺及泛癌开发核心探针+个性化探针，实现10,0000X超高深度，加持独创ER-Seq技术，实现多重有效降噪。目前，该项全新升级技术1021个性化定制MRD检测已能够院内落地，覆盖首次MRD检测、预后预测、复发监测及疗效评估。

而在病原感染方面，吉因加于年会发布病原检测新产品tNGS-Max，可全面覆盖血流感染、呼吸系统感染及中枢神经感染症候群。其采用种+属级别探针，无限趋近于mNGS，满足99%病原检测需求，高密度平铺探针设计，LOD低至5~25copies/mL，能够实现低载量高效检出；同时通过耐药基因全基因组探针叠加设计+高深度测序覆盖，还能精确识别耐药位点。

即使是再往前探一步的复杂疾病领域，吉因加也已启动了中国人健康队列的血液cfDNA甲基化基线数据库及中国人细胞特异甲基化图谱建设工作，构建了40种细胞类型的Baseline，并且基于公司独特的甲基化技术，与多家单位合作开展了器官损伤科研项目的探索，是科研探索到临床应用转化方面名副其实的“吉先锋”。

而令人更可喜的是，我们发现很多传统限于临床、病理、检验、药企等圈子的产品和模式设计开始更多地走向C端。譬如，目前更多只在临床诊疗中所接触到的MRD技术，也逐渐走向普罗大众的日常。会上，吉因加正式发布了针对术后肿瘤患者的“愈实惠·惠健康 五年关爱 惠民共创”项目。该项目由吉因加联合京东健康、火山引擎、灯塔肿瘤医生、咚咚肿瘤科、患友之家等平台共同发起，旨在为早期术后患者提供MRD检测（基线+逐次）为核心的更高精准、超实惠、个性化的术后康复计划，以提高患者的生活质量和健康水平。