赛福基因:基因数据解析与精准医疗,一群学霸的创业故事

作者:周梦亚 2016-12-16 08:00

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“人类所有疾病,除了创伤以外,可能都跟遗传基因密不可分。”告诉记者这句话的,是赛福基因的创始人兼CEO余伟师。


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赛福基因的创始人兼CEO余伟师 


赛福基因是一家基因数据分析解读及基因诊断产品的研发服务商。与其他基因检测相关企业不同,赛福基因主打的第一个产品不是当下热门的循环肿瘤DNA(ctDNA)检测,不是无创产前,而是目前国内少有人涉足的神经性疾病——癫痫。


余伟师告诉记者:“别看现在癫痫的精准医疗产品市场上还非常稀缺,但这是继癌症之后最有可能实现精准医疗的疾病,我们希望团队专家的努力能真正帮助到临床医生对患者的精确诊疗。”


目前,全世界大约有6500万人受到癫痫困扰,其中80%生活在发展中国家。中国的癫痫病例占人口总数的千分之七,接近900万人,并且每年还有40万的新增病例,更严重的是,超过50%的患者是儿童。“所以癫痫的精确诊断和有效治疗,迫在眉睫。”余伟师说这句话的时候,显得格外严肃。


跨学科学霸团队  

64位博士


“其实刚开始建立这个团队的时候,是因为看到人类疾病的复杂性,而通过一己之力根本无法解决多大的问题,只有团结更多的能人才能去做点什么,把基础技术转化为临床应用。”余伟师回忆起自己的创业过程。


2011年,博士毕业的余伟师进入美国国立卫生研究院(NIH)从事基于再生医学诱导干细胞的表观遗传学研究。而在此之前,余伟师就一直从事肿瘤、疾病与基因相关研究,寻找基因信号通路与疾病、肿瘤发生发展的联系。随着研究的深入,对基因与疾病的联系有了更深的认识。于是他开始思考:如何才能把这些技术用到临床上,对临床应用有所帮助。


机缘巧合,去美国两年之后,余伟师认识了几位志同道合的朋友。其中就有包括了现在公司的联合创始人刘湘涛以及其他核心成员。当时一行人在谈起基因测序的时候,觉得未来个人基因组测序成本必定会下降,而随之产生的海量数据的高效高质量分析和解读将会面临巨大挑战。“大家想,在美国我们有那么多华人博士一直是所在机构的技术攻坚手,如果能把大家聚集起来是不是可以产生更大的化学反应。”余伟师表示。接下来,他们几人就自己集资,将团队成员的血液送去测序,然后进行实战数据解析。现在想来,也正是当时那股闯劲,才逐渐聚集起今天的团队。


2013年,团队雏形建立完成。虽然只有五个人,但涵盖了生物信息学、分子医学、遗传学等多个学科。“当时大多数时候还只能拿一些公开的基因数据做探索,进行一些模拟训练,看能不能对将来的临床有所帮助。”余伟师回忆道:“当时是有这么一个愿景,还没有想到可以做成公司。”


也许是幸运,也许是技术够扎实。不到三个月,团队就接到了第一个Case。广东中山医院托人找到余伟师,希望他们能对一位患者的全外显子测序和RNA-Seq数据进行分析。没有透露病人具体患了什么癌症,也没有病人的任何其他信息,完全是一场盲测。


“当时我在想,既然接受了挑战,那就尽最大努力试试吧。”抱着这样的心态,余伟师和团队开始了数据深度分析和解读。考虑到癌症治疗时间节点的重要性,几个人不眠不休的赶了一周,终于完成了分析报告。最终结果显示:病人男,35岁,肠癌患者,临床诊断结果完全符合!


但真正让余伟师兴奋的,其实是病人的靶向药物位点的检测结果。报告显示,病人的几个位点是与当时的临床靶向药物相关的。也就是说,有了这个报告,医生可以根据上面的建议给病人直接进行靶向治疗。“能用于临床的发现,比之前技术研究的发现更加让人激动。”回忆起第一单,余伟师还是显得很激动。


也就是那个时候,余伟师感受到:自己现在做的事情,是对临床有用的。但另一方面他又在考虑,这么一个病人几个人就每日每夜的搞了一个星期,那如果今后患者多了怎么办呢?思考之后,余伟师决定:要扩大团队,更要建立一个能降低人工成本的基因数据智能解析平台!


接下来的时间,余伟师利用周末的时间开始有意识的去参加各种投资创业活动,接触医疗领域跨学科的专业人士,整合资源,壮大团队,2013年当选为NIH-frederick中国学生学者联谊会主席,并兼任美国华盛顿青年创业协会会长,美国华人专业联合会理事。经过2年的时间余伟师在美国联合了64位华人博士组成了一个专家团队,耗时两年时间构建了一个独有的疾病、基因、药物关联数据库。目前,这个数据库中包括一万多种疾病相关的基因与基因突变位点信息,并且还在不断的实时更新。2015年,中国的创业掀起热潮,余伟师决定带领团队回国创业成立公司。他放弃了在联邦政府部门相对稳定的工作,放弃了正在提交材料的EB1A绿卡申请,放弃了一百多万美元的NIH政府经费和升职机会,报名参加了微软加速器的全球项目海选,并以2%的录取率,从1500家企业中脱颖而出,入选北京微软加速器。一年过去,团队博士有超过10人陆续全职出来,涉及在癌症领域、遗传疾病、生物信息学和遗传咨询多个领域,这是其他团队在短时间内难以复制的优势。


数据分析是瓶颈

也是未来方向


“我读博士的课题是肿瘤基因信号通路研究,那个时候很少涉及二代测序和生物信息,我做的全是一代测序相关的实验,有时候会下载一些网络公开二代测序数据,但难于找到合适的数据分析师帮忙,自己做数据处理又非常复杂。”余伟师认为,数据分析一定会是将来基因检测的难点和关键所在。


“在NIH的时候,资源都是共享的,有自己的测序中心和分析团队,可以经常和他们进行交流并实现分析数据的解读,从那个时候开始就对二代测序数据分析和解读深有体会。”余伟师表示。当时二代测序在美国已经是成熟的技术,在中国还处于初期阶段。考虑到基因检测未来可能出现的瓶颈,也结合自己的优势,余伟师进一步坚定了以二代测序基因数据分析和解读为创业方向。


安晶,自动化分析平台

帮助实现癫痫精准诊疗


“回国以后,我们还没有自己的实验室,像肿瘤这样跟时间赛跑的疾病领域还不具备客观条件。”余伟师表示:“再加上肿瘤复杂程度,目前靶向药物非常有限,市场上这类型产品太多,有很多非常优秀的企业也走在了前面,我们选择了与国内肿瘤医院合作做更深层次的针对我们中国人族群的肿瘤产品研发。”


早在美国的时候,我们对神经内科疾病特别是癫痫就有一定的研究积累,对我们来说,这是优势。因此我们首先推出了癫痫临床筛查、诊断和治疗结合产品——安晶。安晶的推出,是中国癫痫精准诊断和治疗从零到一的突破。最大的特点是将全基因全外显子组检测应用到癫痫的诊断诊疗。


癫痫的发病因素很多,其中60%以上都是遗传决定。目前,国内尚未有一家公司将癫痫的基因、病因和药物相关性做一个系统深入的研究并开发成产品。“从这一点看,我们具有先发优势。”余伟师表示。


传统的基因包(Gene Panel)只能筛查出已知位点突变引起的疾病,对原发性未知突变则显得无力。安晶的突破就在于将全基因检测应用到癫痫临床检测上,开创了癫痫诊疗的新模式。不仅能筛查出已知位点突变疾病,也可以用于原发性未知突变引起的癫痫疾病筛查与精确诊断,覆盖面积更广,阳性检出率也提高了50%。通过对癫痫机理更深入的了解,可以为临床给药提供更多的参考价值,能更好的辅助临床诊疗。


今年10月,公司举行了基因数据智能解析平台发布会,实现了安晶产品的自动化分析流程。


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平台通过对数据库进行自动搜寻比对,可对已知位点进行自动化数据过滤匹配,自动生成检测报告;对于文献中已经出现的未知位点,我们设计构建的计分系统将自动对这些位点进行筛选,然后通过人工校验的方式实现。此外,更大的亮点在于平台的双重风险管理系统,从基因水平和突变位点水平对患病风险做出更精确的预判。余伟师透露,平台具有机器学习能力,随着样本量增加,风险管理的准确性会随之更加精准。


“后续我们还将对平台调整升级,进一步提高美观度和使用便捷性做好用户体验,最终希望通过手机就能实现访问。”余伟师表示:“这个过程中我们也一直都在跟临床医生沟通,也会把临床医生的反馈增加到里面。”


合作临床

深入疾病探索


目前,安晶作为第三方检测的B2B2C产品,主要与临床医生合作。这个过程中,技术和准确性很重要,首先要得到临床医生的认可,才会有患者来做检测数据分析,医生才会把报告视为临床诊疗的依据。余伟师表示:“我们的底层技术架构是别的公司很难具备的,这种对数据专业的分析和解读,对临床有很好的指导作用。”


“为了建立更好的癫痫诊疗产品,我们在底层神经系统的技术研发会不断投入,而且也会吸收更多专业人才。”余伟师告诉记者。他想做的不仅仅是癫痫的诊断,更多的是对基因位点和疾病联系深层次的探索。目前,公司已经与一些专家建立合作,希望通过对样本的积累,可以发现新的生物标志物。这不仅具有目前诊断意义,更是未来临床治疗要考虑的方向。


此外,公司还在苏州建立了分公司,计划推广消费级健康人基因检测产品全晶。全晶主要针对健康人群的重大疾病筛查和健康管理。余伟师认为,虽然从目前来讲消费级基因检测并不是刚需,但极有可能是下一个消费科技。当中国人群的基因数据积累到一定的时候,通过基因检测对疾病的精准定位和对健康人的疾病预防与健康管理将会更有把握。这一个需要时间过程,利用基因科技接触所有消费者并且从本质上去影响他们,是件不容易也是非常了不起的事情。”余伟师表示。


下一步,公司希望把安晶等产品推广到更多的医院,帮助更多的临床患者。同时,余伟师还希望能够建立更专业的销售团队,扩大产品渠道。在产品研发上,将继续安晶产品的升级优化,同时还希望推出针对自闭症和老年痴呆症等相关临床诊疗产品,将一个又一个困扰和折磨人类健康的疾病实现精准化诊疗。


公司于今年二月,完成了天使轮融资,由创见资本、将门创业、朗玛峰创投三家机构共同投资,下一轮融资已于数日前启动。

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