推动人工智能与机器学习应用,奕真生物宣布收购Curoverse

作者:周梦亚 2017-08-07 10:50

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近日,奕真生物宣布对生物信息公司Curoverse进行收购。此次收购将加速大规模人工智能与机器学习在基因组学中的应用,打造全球首个百万级人类基因组自动解读平台。

 

被收购方Curoverse成立于2010年,是一家领先的计算与生物信息公司,采用开源软件为基因组和生物医学数据提供管理、计算和共享服务。

 

Curoverse起源于哈佛大学,起初是哈佛大学医学院发起的“个人基因组计划(PGP)”背后的数据处理服务商,随后公司采用开源软件为基因组和生物医学数据提供管理、计算和共享服务。

 

被收购前,Curoverse的核心业务是基于Arvados(一个免费的开源数据管理平台)的免费开源系统,为Arvados用户提供技术支持服务。惠康基金会 (Wellcome Trust)、桑格研究院 (Sanger Institute) 等行业领军者都已采用 Curoverse 开发的软件,管理、处理和分享海量基因组及生物医学数据,并辅助人工智能和机器学习的应用。

 

奕真生物是位于波士顿的一家生物技术公司。公司成立与2014年,致力于向全球领域提供全基因组检测和有针对性的遗传性癌症及生殖健康筛查服务。奕真生物的中美团队分别在美国波士顿和中国杭州建立了两个辐射欧美及亚太地区的兄弟公司和研发中心,同时又在波士顿、卢森堡和上海拥有3个地区市场总部。这家公司被MIT评为“2016 年度全球 50 家最聪明的公司”。

 

奕真生物的创世团队包括华人科学家赵奕宁博士、哈佛医学院基因科技先驱George Church教授、美国企业家Mirza Cifric。有趣的是,这次收购的买卖方都是Church系的公司。

 

此次收购将扩大奕真生物与 Curoverse 原有的合作,进一步强化生物信息平台 Arvados 的产出量和数据管理能力,并有效地在该平台上部署人工智能和机器学习。Arvados 中的数据预计今年将超过 10PB(1PB = 1024TB)。

 

对基因技术公司而言,基因组数据是非常宝贵的资源,但对于数据的生成和保存目前并未形成既定的规范。

 

奕真生物共同创始人和首席执行官 Mirza Cifric 表示:”人工智能和机器学习以发掘这些宝贵信息,行业急需一个标准化的方法,在不受地理和组织限制的情况下,实现快速且安全的数据访问。

 

奕真生物共同创始人和首席执行官 Mirza Cifric 解释道:“奕真生物正在打造一个平台,这个平台不仅包括了测序技术,更重要的是能够每年解读成千上万,甚至上百万的人类全基因组。要实现这一目标,唯一方法就是大规模部署人工智能和机器学习。”

 

他认为,要实现这一目标需要用标准化的方式对数据进行生成、储存和管理。Curoverse 在这一领域实力卓越,奕真生物和 Curoverse 两个团队将能够更加紧密地合作。

 

“这不仅有利于奕真生物,对整个基因组行业也是有利的。”Cifric 表示。

 

除了创造出Arvados,Curoverse 团队还因推动 CWL 标准 (Common Workflow Language) 的基础性建设而闻名。CWL 标准已被众多一流研究机构应用于基因组数据的处理和整合。Curoverse 的数据联合模型允许不同基因组信息数据库通过 CWL 标准与整个社区共享,同时可以继续留在其原始创建域中。

 

奕真生物共同创始人和亚洲区总裁,赵奕宁博士表示:“奕真生物在中国正在与越来越多的医院与科研机构展开合作,推动临床基因检测的快速发展。通过与 Curoverse 经验丰富的团队合作,我们将利用 Arvados 平台逐步实现大规模自动解读,加速中国临床基因检测平台的建设。”

 

双方将基于Arvados平台扩展其功能性,使现有的客户和整个基因组学开源社区参与者都能从中受益。

 

两家公司共同的联合创始人与顾问,George Church 教授表示:“在全球范围内,很少有公司拥有超过 10 年的基因组数据整合和机器学习应用经验。我很高兴能看到这两个团队能更加紧密地合作。奕真生物和 Curoverse 都向着共同的技术目标前进,同时也致力于提供可付诸行动的宝贵信息,使更多人能获取这些信息。”

 

收购完成后,Curoverse 将作为奕真生物的全资子公司运营业务,目前收购的金额暂未披露。

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