百洋智能科技与拓普基因达成战略合作,人工智能将加速基因测序的发展

作者:动脉网 2018-01-09 17:51

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1月9日,动脉网获悉,百洋医药集团旗下百洋智能科技与拓普基因在北京正式签署合作协议,双方将整合资源,促进 Watson for Genomics(Watson基因解决方案,以下简称WfG)在中国的落地发展,助推WfG进驻拓普基因覆盖的所有城市。随着双方合作的达成,这也意味着WfG将全面提速进入中国的肿瘤治疗体系。

 

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百洋智能科技CMO王必全女士、拓普基因联合创始人孙刚先生共同出席本次签约仪式

 

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政策促进AI与基因相结合

 

作为一种新型基因检测技术,基因测序可以通过血液、其他液体或细胞对DNA进行检测。目前,基因测序历经了四代创新发展,在成本、通量水平和精确性上已达临床普及应用水平。随着疾病图谱不断变化、国家大力提高医疗水平、国民健康意识提高,基因测序的发展从2007年的7.94亿美元增长到2013年的45亿美元,年复合增长率为33.5%。预计未来几年依旧会保持快速增长,2018年将达到117亿美元,年复合增长约为21.1%。

 

伴随基因测序在临床的普及,国家政策也逐渐向其倾斜。2017年5月,《“十三五”生物技术创新专项规划》印发,旨在加快推进生物技术与生物技术产业发展,到2020年实现整体“并跑”、部分“领跑”。

 

其中提到,发展新一代基因测序技术,重视单分子技术在其中的应用和测序数据的分析解读。此外,国务院还于去年7月发布了《新一代人工智能发展规划》,指出基于人工智能开展大规模基因组识别、蛋白组学、代谢组学等研究和新药研发。政策利好为AI与基因行业的结合创造了良好契机。

 

作为专注于乳腺癌、卵巢癌等女性癌种基因测序的公司,拓普基因以 “基因+转诊”整体化服务、“科研+临床”应用相结合,以及“基因+细胞” 双引擎驱动模式,推动精准医疗临床应用。

 

拓普基因联合创始人孙刚指出:“基因测序技术和精准数据解析是帮助实现肿瘤患者精准医疗的两大要素,二者的有机结合在有效提高癌症用药效率的同时,还能够寻找患者适用的疾病靶向治疗药物或者其它的治疗手段。此次我们与百洋智能科技在WfG解决方案的合作可以有效帮助患者提高治疗的精准性。”


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人工智能打破基因测序发展瓶颈


尽管基因测序已达临床普及应用的水平,但数据计算依旧是其最大瓶颈。基因组所涉及的数据量是TB级的,要实现这些数据在不同用户之间平滑、及时地传输和分享,对很多数据科学家来说都是挑战。通常情况下,全基因组分析需要花几周的时间,这个时间对很多临床医疗服务而言过长,所以必须要加速临床或者门诊对基因组的分析速度。

 

从现阶段来看,基因测序的确能够获取更多具有临床可执行性的突变检测结果,更加有利于辅助医生进行肿瘤的临床精准治疗,但同时它也需要更加有力的人工分析支持。多数肿瘤的发生和发展伴随多个基因的多种变异形式,人体所携带的癌症相关基因近500个,有近1000万种基因变异表达方式。


据动脉网了解,目前全球顶级的非人工智能基因测序公司可识别的基因变异种类最多不超过10万个,且需要耗费大量时间。由于解读人员水平参差不齐以及基因数据库匮乏等问题,使得无法在解读过程中避免遗漏。因此,肿瘤精准治疗需要一个精确且无遗漏的智能决策助手。

 

而基于人工智能技术的WfG的诞生则赋予了实现肿瘤患者精准医疗大规模应用的可能性。WfG可在短时间内规模化地从结构化和非结构化的信息源中提炼所需信息,并进一步进行机器学习。同时,WfG能够了解并读懂肿瘤具体的变异情况、病理学情况,并重建知识库、识别潜在治疗方案,帮助医生节省精力和时间,做出精准的治疗决策。

 

目前,WfG解决方案已经支持目前所有已知的肿瘤类型,包括但不限于肺癌、乳腺癌等常见的实体肿瘤、白血病、淋巴瘤、骨髓瘤在内的血液肿瘤和原发灶不明及罕见肿瘤等。同时,WfG已经与美国14家顶级癌症中心和独立医学实验室的专家团队建立了合作社团,使临床解读更加规范化。

 

美国顶级癌症研究院北卡罗来纳大学莱恩伯格综合癌症中心对WfG进行了综合的评估研究,对于1018例入组患者,经靶向全外显子测序和生信分析后,WfG在3分钟内即完成每例患者的临床解读;解读结果不但包括了该中心专家组的解读,还额外发现了8个可靶向治疗基因,因此而潜在获益的患者达32%(323/1018例)。

 

百洋智能科技CMO王必全指出:“我们很荣幸能够与拓普基因达成此次战略合作。近年来,基因测序市场的快速发展让我们看到个体化医疗需求的急迫性,因此我们将认知医疗领域最为成熟的WfG带到了中国,并将携手拓普基因为基因检测插上人工智能的翅膀,共同推动精准医疗解决方案的落地应用。”

 

作为百洋医药集团互联网应用生态圈的主体,百洋智能科技致力于科技改善健康,此次与拓普基因携手也是该公司继去年9月与贝瑞基因达成合作后,又一加速推进WfG在中国全面落地的重要一步。

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