NanoString:数码分子条形码技术在肿瘤治疗中的运用

作者:动脉网 2015-12-31 08:10

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NanoString是一家生物医药公司,作为第一类对数字分子条形码技术做了分类的企业。 NanoString开发了能够同时分析多种物品的类型及组织特性的一个样品装置。这意味着,在同一个电子管中,研究人员可以通过一个复用的方法研究一个通路,以此捕获mRNA,DNA和蛋白质等物质所表达的信息。

数字分子条形码技术作用的发挥是通过3D生物的方法来实现的。在该公司的旗舰产品中,NCounter分析系统可以分析多达800种不同的条形码,且借助分析系统将极大地提高对条形码技术的研究能力。而在肿瘤学领域,数字分子条形码技术则尤其重要,NanoString主要致力于分析癌症免疫应答的复杂性以及预测生物标志物的开发前景。在他们的乳腺癌基因组测定过程中,开发配套的临床诊断方法是解决癌症顽固性的主要方向。

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PanCancer途径小组展示了他们新开发的产品,在一年一度的SITC会议上,PanCancer途径小组与NanoString公司成员针对肿瘤治疗方法和技术手段进行了现场讨论,相关负责人进行了发言。

托马斯Obisesan,Medgadget:是什么促使你参与Nanostring公司的研究活动?

约瑟夫Beechem:我是一个教授,我从事生物制药工作大约11年了,科学技术的发展改变了生物制药的环境,科学对于发展生物制药的意义重大,你可以利用科学所创设的学术环境,但是科学的发展也束缚了个人想法的发挥,个人专业素养的应用真的相当有限。所以我决定我要走出去,走到更加广阔的领域,在那里,我将可以利用所学知识创造有用的技术。

于是,我离开学术界去了一个小型生物技术公司,该公司位于美国俄勒冈州,该公司主要致力于研究分子探针技术。在大约三年半前,我曾经在一个规模较大的生物科技公司工作。我利用新技术重复同样的工作,但是工作的性质发生了变化,而我几乎没有意识到这种变化。于是我明白有一些事情的效果你不能仅仅采用单纯的测序方法进行衡量。我需要找到另一种方式来明确新技术对于生物制药的重要作用。

有些事情我不想轻易放弃,但实际的实验结果却与理论数据存在巨大差别。所以我一直在寻找能够被更广泛使用的基础样蛋白技术,该技术的使用使得在同一个单管里做各种各样的东西成为可能。所以,当我环顾四周的科学发展状况,我发现了光学条形码技术。我意识到我终于可以使用光学条形码来计算各种不同种类的分析物,并利用3D生物的办法开展研究工作,鉴于以上个人的经历,我选择了参与NanoString公司的研究活动。

布拉德•格雷:我的经历是五年前我从临床实验室行业转业进入Nanostring公司。我主要从事产品开发和业务实验室开发的部分工作,我个人成立的研发团队希望把技术应用到实验室以此构建多基因的癌症检测系统。另外,Nanostrings公司也将考虑能否在同一时间进入诊断环节。于是我就加入了该公司。

我个人最大的期望是通过采取某种技术对癌症基因进行实时监测,通过FDA的研究我已经收获了众多的坚定追随者,所以我们在会议上对癌症测试默克细胞源进行了分散性但却及其热烈的讨论。我不得不承认,这确实是一个很大的目标,在过去的五年中,除了建立癌症检测系统研究能力,我们已经通过各种途径试图将癌症监测系统直接与客户端相联系。

路易Welebob:我的名字是路易斯Welebob。我领导的全球营销组Nanostring已在生物制药领域取得了极大的成就。我主要从事制药业的小分子开发和疫苗研发工作,并进一步将该工作发展到技术应用领域。在进入Nanostring公司之前,我曾广泛地接触芯片和质谱研究领域。在来到Nanostring公司之后,我工作的重心转到了诊断领域。

Medgadget:所以我们的目标是将实际研究成果运用到临床诊断过程中吗?

布拉德•格雷:这是正确的,今天我们都知道最流行的系统是一个名为flex的系统,实际上该系统是经FDA批准运行的第一个诊断检测,主要在乳腺癌检测工作中使用,而这一切都只有研究者所研发的产品能做到。因此,在癌症中心实验室我们可以购买一个系统,经过研究者的研究和分析,我们可以把它运用在诊断模式中。

Medgadget:那么是什么导致该种光学条形码技术被应用到专门的肿瘤治疗平台?

布拉德•格雷:我们首批客户群主要包括一些癌症研究人员,而实际上,我们已经采取了FDA的乳腺癌检测技术,该技术被称为Prosigna的第三个恒久客户。所以早在之前一段时间,我们就将该产品研发出来并投放到研究市场,之后,癌症监测中心逐渐接受了该产品。他们之所以这样做,原因是癌症生物学研究工作缺少组织性从而产生了太多的生物学问题,提取该组织基因被认为是癌症研究过程中最严重的地方。

乳腺癌监测技术的研发是由福尔马林被固定在paraphynetic问题中所产生的,福尔马林所使用的对象基本上都是干尸,这使得它真的很难与其他技术工作相融合,但我们技术的伟大之处就在于将福尔马林与乳腺癌监测将结合。所以在很早之前,遗传信息的保留使得我们摆脱了活体监测的障碍,从而找到了对干尸进行监测的方法。

因此,鉴于目前的这一趋势,我们最终做出了一个重要决定,该决定主要针对癌症整治技术研究公司的未来发展。我们的技术不仅可以用于癌症研究工作,同时也能够诊断极其美好的事物,癌症研究工作的开展已经成为我们公司的组织目标。我们公司几乎所有的产品开发工作都将如何更好的治疗癌症作为工作重心。

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Medgadget:如何进行自受孕的系统进化?

布拉德•格雷:乔一直在努力使NCounter酒店的Sprint系统能够提供更加实惠优质的服务,因此他在系统内部内置了独立的研究员。

乔Beechem:我们制作这个仪器的成本是非常高的,仪器大概相当于两个箱子的大小,我们讲仪器制作成一个盒子的形状,仪器变成了放置在其他系统内的微卡,它是一个统一的系统,大约花费了$149,000 ,该系统邮由个人研究产生,出去了宣传成本和管理费用,因而比较实惠

布拉德•格雷:这是一个重要的事件,而另一件大事就是我们所说的三维生物的诞生。

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乔Beechem:当我们不可避免地遇到了癌症,我们就非常想促进癌症技术不断向前发展,而个别技术的发展并不能完全遏制癌症的发生,个别技术并不擅长分析生物类型的交叉边界。该分析工作主要由蛋白质和核酸参与进行。在实际的实验过程中,仅仅需要在免疫肿瘤中进行研究即可。

免疫肿瘤的研究几乎成为了爆炸性的领域,几乎如同一场革命般迅猛。而另外一件事则是,我们认为这款3D生物学方法非常适合于治疗免疫肿瘤。你必须能够从DNA水平,蛋白质水平和mRNA水平中挑选信息碎片,并将它们相结合。我想,这就是为什么我乐于使用3D生物学方法,而你看到的数据仅仅是平面上的。

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Medgadget:在Nanostring公司已经申请的技术中,你最喜欢的是哪一项?

乔Beechem:如果该公司的技术进行整合,我想我们每个人都有自己的最爱。

布拉德•格雷:这就像问你最喜欢哪一个孩子。

乔Beechem:你知道,我真的很喜欢这些研究者的研究方法和途径,并将定量研究最为基础。我真的很佩服一个研究员,她的名字是特拉维夫雷格夫。特拉维夫是一个女人,她最为伟大的成就是从根本上了解哺乳动物细胞如何利用表达机制,以及他们是如何调节情绪、如何长时间生活等方面。她曾与我们合作了很长时间。

布拉德•格雷:我最喜欢的可能是更多的应用良好的基础科学,在2014年1月,研究人员还不知道如何有效的真正的建立临床诊断分析体系。我的意思是他们不仅仅是为了完成工作。而是将我们的技术运用在内置理想BCL测试实践活动中。我们利用细胞源进行相关测试,他们开发了优质高效的产品,当我们把产品带回来的那一刻,我们并没有试图改变它。

我们的技术已经允许研究人员建立个人诊断系统,以此诊断世界上各种类型的疾病。在开发产品之前,他们进行了极其复杂的多侧面分析验证工资,他们跑了三个不同的实验室,并证明他们得到了相同的结果。这是一种学习过程,在反复的研究中研究活动取得了良好的效果。这是我的最爱之一,即技术的伟大之处在于其研究、探索的过程。

路易Welebob:我最喜欢的是我们没有把Prosigna进行市场化的营销。我看到的是人们努力打造的签名,基本上成了Prosigna的签名。我看到的是他们研究数据准确性,可靠性、可重复性。当它成为Nanostring家庭的一部分,Prosigna试验数据的完整性大大加强。在乳腺癌研究领域,你永远也看不到其他任何东西比这更加完整。这是最严格的数据集,你永远不会看到。

所以从我的角度来看,今天的Prosigna是目前市场上最为科学的癌症治疗中心。现在我们看到的肿瘤科医生都是利用这个测试的优势进行医疗技术的改进和治愈率的提高。乔开发的技术,已经帮助多位乳腺癌患者摆脱了疾病的折磨,这无疑是医学界过去十年内最为深刻的事件之一。

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Medgadget:如何洞悉公司未来的产品研发和发展方向?

乔Beechem:这种3D生物学的方法是我们第一次在课堂上接触到的。他们称3D生物学技术就如同一片蓝色的海洋区域,是一个人们从未接触过的领域。我们正在使用先进的技术进行探索和发现,你能看见众多生物制药公司纷纷开展合作,向着真正尖端的肿瘤学研究和免疫疗法前进。我认为这是真正改变癌症治疗和诊断困境的首要方式,我几乎不敢相信会发生如此大的变化。

以前,我认为,我们看到的最后一代人将死于癌症。你们这一代或下一代,你会死于别的东西,但希望它不会是癌症。而我们的角色是帮助加速治愈癌症的发展,这是一个非常令人兴奋的研究领域,因为它与人类未来的发展息息相关。

布拉德•格雷:大多数公司是技术公司,但是我希望永远不要做这样的陈述。公司不应该仅仅专注于一个特定的疾病治疗领域,或者他们并不应该讲自己的使命固定化,而应该利用一切可能的技术实现癌症治疗手段的突破,从而为患者提供缓解病痛的工具。

我认为这是一件极其重要的事,因此,作为Nanostring公司的一员,我们是非常自豪的。如果你去进行调查,询问我们的员工,询问为什么他们早早起床,我相信大多数人会告诉你,因为责任。即使我不再从事生物制药工作,我仍旧保留个人的责任感和探索精神。

路易Welebob:未来的市场需要更好的测试技术,无论是单个样品的检测工作,还是数据的检查工作,测试技术理应被最大限度的开发,以此得到的不只是一个数据点,而是一片数据区域。我相信我们正在做的努力。当你开始思考3D生物技术的优势时,技术研究的进展才能真正加快。所以这就是你看到的现在,事物的出现衍生了众多领域的发展,而我们正在重新设定规则,以此促进3D生物技术的发展和蓬勃。

公司未来的产品研发和发展方向也将朝着技术化、信息化方向发展,3D生物技术的出现为公司的发展带来了新的契机,同时也带来了众多挑战,如何应对,这将是公司需要思考的一个方面。

编译:陈坤

责编:张楠

 

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